Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GRIK4Q16099 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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