Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms