Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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