Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.463e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.43e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.313e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.283e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -03e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.033e-7■■□□□ 11.9
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PCBP2Q15366 AL121845.2-202ENST00000476221 446 ntTSL 516.7■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.142e-6■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 JAK1-201ENST00000342505 5047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.654e-6■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 SOX5-204ENST00000441133 638 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.732e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CREBBP-208ENST00000573517 718 ntTSL 59.58□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CREBBP-203ENST00000570939 3316 ntTSL 58.52□□□□□ -1.042e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 SOX5-213ENST00000541847 758 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.12e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CLASP1-205ENST00000430234 582 ntTSL 46.71□□□□□ -1.343e-6■■□□□ 11.9
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PCBP2Q15366 CHKB-212ENST00000492582 2069 ntTSL 228.47■■■□□ 2.156e-9■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CHKB-208ENST00000479003 2114 ntTSL 227.05■■□□□ 1.926e-9■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CHKB-CPT1B-203ENST00000492556 4906 ntTSL 220.41■□□□□ 0.866e-9■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.776e-9■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CHKB-209ENST00000481673 1856 ntTSL 1 (best)19.62■□□□□ 0.736e-9■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CHKB-204ENST00000465842 428 ntTSL 217.81■□□□□ 0.446e-9■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CHKB-202ENST00000463053 886 ntTSL 315.51■□□□□ 0.076e-9■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.742e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 EIF4G1-237ENST00000485712 474 ntTSL 417.95■□□□□ 0.462e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 RUNX1-208ENST00000455571 610 ntTSL 317.27■□□□□ 0.362e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 JPX-213ENST00000640437 1620 ntTSL 516.61■□□□□ 0.252e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.112e-13■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 PPP1R15A-202ENST00000600406 1725 nt15.69■□□□□ 0.12e-13■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 PLEKHA7-201ENST00000332954 2192 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.082e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CLIP1-216ENST00000541410 2379 ntTSL 1 (best)14.26□□□□□ -0.132e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.372e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 MIR3610-201ENST00000582903 73 ntBASIC12.21□□□□□ -0.452e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 PLEKHA7-218ENST00000636113 2981 ntTSL 511.92□□□□□ -0.52e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 SORBS2-232ENST00000450341 567 ntTSL 411.67□□□□□ -0.547e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 TRIM26-269ENST00000480999 3114 ntTSL 211.45□□□□□ -0.582e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 PLEKHA7-213ENST00000531776 3591 ntTSL 211.45□□□□□ -0.582e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CLIP1-219ENST00000620786 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.632e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 RNF213-207ENST00000559070 4644 ntTSL 1 (best)10.87□□□□□ -0.672e-6■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CLIP1-203ENST00000361654 5568 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.712e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CLIP1-213ENST00000540338 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 PLEKHA7-219ENST00000637162 3602 ntTSL 510.41□□□□□ -0.742e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 PLEKHA7-210ENST00000530489 3688 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.752e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CLIP1-209ENST00000537178 5229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.762e-8■■□□□ 11.9
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PCBP2Q15366 JPX-201ENST00000414209 2194 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.82e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 CLIP1-202ENST00000358808 5880 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.812e-8■■□□□ 11.9
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PCBP2Q15366 JPX-211ENST00000602985 476 ntTSL 37.36□□□□□ -1.232e-8■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.312e-6■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.342e-8■■□□□ 11.9
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PCBP2Q15366 SORBS2-244ENST00000464975 563 ntTSL 45.5□□□□□ -1.537e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.562e-6■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 SORBS2-233ENST00000451701 582 ntTSL 35.24□□□□□ -1.577e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 SORBS2-228ENST00000445343 546 ntTSL 44.87□□□□□ -1.637e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 SORBS2-239ENST00000457247 573 ntTSL 43.72□□□□□ -1.817e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 SORBS2-240ENST00000457934 553 ntTSL 43.49□□□□□ -1.857e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 SORBS2-227ENST00000445115 575 ntTSL 43.36□□□□□ -1.877e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 SORBS2-238ENST00000456596 574 ntTSL 42.94□□□□□ -1.947e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 SORBS2-217ENST00000430503 499 ntTSL 52.8□□□□□ -1.967e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 TIA1-218ENST00000496096 511 ntTSL 36.64□□□□□ -1.353e-11■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 TIA1-209ENST00000474699 686 ntTSL 26.48□□□□□ -1.373e-11■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 TIA1-207ENST00000454815 911 ntTSL 56.15□□□□□ -1.423e-11■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 TIA1-214ENST00000482876 562 ntTSL 54.66□□□□□ -1.663e-11■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 TIA1-212ENST00000477415 510 ntTSL 24.59□□□□□ -1.673e-11■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 USP10-210ENST00000563892 570 ntTSL 317.2■□□□□ 0.349e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 USP10-215ENST00000569038 730 ntTSL 310.1□□□□□ -0.799e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 USP10-218ENST00000570053 502 ntTSL 35.82□□□□□ -1.489e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 SLC2A4RG-208ENST00000496425 502 ntTSL 215.77■□□□□ 0.127e-15■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 ETV5-212ENST00000484223 590 ntTSL 46.76□□□□□ -1.337e-7■■□□□ 11.9
PCBP2Q15366 P4HA1-206ENST00000464310 415 ntTSL 55.45□□□□□ -1.549e-10■■□□□ 11.8
PCBP2Q15366 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.023e-15■■□□□ 11.8
PCBP2Q15366 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.13e-15■■□□□ 11.8
PCBP2Q15366 DUSP3-202ENST00000590342 2077 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.253e-15■■□□□ 11.8
PCBP2Q15366 P4HA2-204ENST00000379100 2563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.573e-15■■□□□ 11.8
PCBP2Q15366 P4HA2-205ENST00000379104 2569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.573e-15■■□□□ 11.8
PCBP2Q15366 P4HA2-203ENST00000379086 2223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.743e-15■■□□□ 11.8
PCBP2Q15366 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.793e-15■■□□□ 11.8
PCBP2Q15366 P4HA2-218ENST00000474628 743 ntTSL 27.49□□□□□ -1.213e-15■■□□□ 11.8
PCBP2Q15366 P4HA2-221ENST00000506807 463 ntTSL 34.6□□□□□ -1.673e-15■■□□□ 11.8
PCBP2Q15366 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.635e-8■■□□□ 11.8
PCBP2Q15366 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.435e-8■■□□□ 11.8
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