Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IHHQ14623 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
IHHQ14623 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
IHHQ14623 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms