Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms