Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CDH13-207ENST00000565636 810 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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MKRN4PQ13434 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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MKRN4PQ13434 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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MKRN4PQ13434 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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MKRN4PQ13434 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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MKRN4PQ13434 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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MKRN4PQ13434 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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MKRN4PQ13434 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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MKRN4PQ13434 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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