Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PMS2P3Q13401 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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