Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms