Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms