Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms