Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPIBQ01892 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms