Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms