Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms