Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA4P51532 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms