Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms