Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms