Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SPRR1AP35321 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SPRR1AP35321 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms