Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCND2P30279 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCND2P30279 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCND2P30279 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms