Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO2P25791 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms