Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms