Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms