Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms