Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PTPRCP08575 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PTPRCP08575 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PTPRCP08575 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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PTPRCP08575 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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PTPRCP08575 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PTPRCP08575 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PTPRCP08575 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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