Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYBBP04839 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.7 ms