Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV12-3P01733 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms