Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEBLO76041 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms