Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms