Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPAG9O60271 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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