Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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