Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRPO00591 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRPO00591 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms