Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms