Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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