Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF24Q9UPV7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms