Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms