Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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