Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms