Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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