Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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