Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM9

C20orf173, Uncharacterized protein C20orf173, humanhuman

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Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf173Q96LM9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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C20orf173Q96LM9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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C20orf173Q96LM9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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C20orf173Q96LM9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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C20orf173Q96LM9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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C20orf173Q96LM9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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C20orf173Q96LM9 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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C20orf173Q96LM9 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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C20orf173Q96LM9 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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C20orf173Q96LM9 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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C20orf173Q96LM9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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C20orf173Q96LM9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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C20orf173Q96LM9 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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C20orf173Q96LM9 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C20orf173Q96LM9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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