Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY4

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16Q96EY4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMA16Q96EY4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMA16Q96EY4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms