Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIRT1Q96EB6 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms