Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ECHDC3Q96DC8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ECHDC3Q96DC8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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ECHDC3Q96DC8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ECHDC3Q96DC8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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ECHDC3Q96DC8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ECHDC3Q96DC8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ECHDC3Q96DC8 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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