Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHIPQ8WWQ0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms