Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms