Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms