Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LRIG3Q6UXM1 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LRIG3Q6UXM1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LRIG3Q6UXM1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LRIG3Q6UXM1 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LRIG3Q6UXM1 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LRIG3Q6UXM1 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LRIG3Q6UXM1 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LRIG3Q6UXM1 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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LRIG3Q6UXM1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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