Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms