Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TTC19Q6DKK2 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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