Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms